BLBanking von Business Logics kann EBICS auf Linux:
http://www.business-logics.de/blbanking.htmlKostet allerdings lockere 250 Euronen.
Und danach wird es schon schwierig. Denn EBICS wird meistens im Firmenkunden-Umfeld eingesetzt. Von daher a) schwierig, an kostenlose oder kostengünstige Lösungen heran zu kommen und b) an Lösungen für Linux heran zu kommen, da Firmen selten Linux nutzen.
Die derzeit generell günstigste EBICSfähige Software ist nach meiner Beobachtung Subsembly mit zus. freigeschaltetem EBICS Modul (kostet extra)
http://subsembly.com/de/banking.htmlKostet - wenn ich mich richtig erinnere - round about 50 Euronen.
Das ist allerdings für Windows. Kann man Windows auf Linux irgend wie emulieren oder kommt das nicht in Frage?
Oder kannst du dir einen Windows PC nur für's Banking daneben stellen? Ich glaube, das wird für EBICS am Ende die günstigste Lösung sein, denn Win7 Pro gibt es ab 30 Euronen bei eBay

Oder du wechselst das Vereinskonto zu einer Volksbank oder Sparkasse. Da gibt es selbstverständlich HBCI/FinTS und da kannst du dann auch hibiscus nutzen.
Ist jetzt eine Abwägung zwischen Anschaffungskosten und Kontoführungsgebühren.