Hallo Marc,
vermutlich benutzt Wiso das web-Interface, das bei jeder Änderung des Layouts der Internetseite vor die Wand fährt.
Da die Commerzbank und bald auch die Comdirect HBCI anbietet, solltest du darauf umsteigen. Ansonsten benötigst du jedes mal ein Update, wenn sich an der Bankseite etwas ändert.