Das geht über die Importschnittstelle.
Bin grad in Urlaub, daher ohne Gewähr:
>>Extras >> Import/Export >> Filter bearbeiten
>> Neuer Filter >> Import; Zahlungen; Feldtrenner ";" Feldbegrenzer "kein"; Felder zwingend Empfängername, E-Kontonummer, E-BLZ;der Rest nach Lust und Laune (Ich würde die Anpassung der VWZ-Zeilen über die Pauschaländerung machen).
>> Neuen (leeren) LS-Bestand anlegen
>> xls so anpassen, dass die Spalten zum Filter passen und als csv speichern.
>> Extra >> Import / Export >> ausführen
>> fertig