Kommt darauf an, wie Du es machen willst: Du kannst per Regeln das Gegenkonto automatisch setzen lassen bzw. Bank X sagen, das es das bei bekannten Kontonummern automatisch macht ("doppelte Buchführung" in den Einstellungen aktivieren). Dann stimmt auch in den meisten Fällen der Saldo automatisch. Wenn Du das von Hand machst, kann es sein, dass der Saldo des einen Kontos erstmal scheinbar nicht stimmt. Beim nächsten Abgleich wird das aber wieder korrigiert.
Wenn Du solche Buchungen wirklich von Hand zusammenführen willst, solltest Du ein Schattenbuchungspaar manuell anlegen, dann wird ebenfalls der Saldo korrekt berechnet.
Ich habe die doppelte Buchführung aktiviert, dann erkennt Bank X solche Umbuchungen automatisch und weist Dich nach einem Abgleich darauf hin. Das funktioniert bei mir gut und ich muss keine manuelle Nachbearbeitung machen
ciao
Christian