Wie genau werden die Daten übertragen?
Über den Punkt "Fremddatei versenden" oder über den Punkt "DTA importieren"? Letzteren Punkt könnte man beispielsweise noch einmal durchführen und im entsprechenden Überweisungsordner schauen, ob die Verwendungszweckzeilen mit übernommen wurden.
Ohne es getestet zu haben noch eine Idee zum Thema: evtl. sind die Konten der Coba nur mit 4 Verwendungszweckzeilen (VWZ) eingerichtet (Auftraggeber/Konten). Alles was dann mit mehr als 4 VWZ eingelesen wird, könnte abgeschnitten werden - wäre meinem Empfinden nach zumindest nicht unlogisch