Bin mir nicht sicher, ob sich Windows das wirklich merkt. Hast du in der Verknüpfung zum Programm denn Vollbild oder "normales Fenster" eingestellt?
Wenn "normales Fenster" schon drin ist (=Standard) dann kannst du m.W. weiter nichts machen. Sowas müsste die Anwendung selbst regeln. Hibiscus-Scripter hat hier m.E. eine falsche Aussage getätigt, soweit es Windows betrifft.
Beispiel: Der Total Commander. Da gibt es extra den Punkt "Konfigurieren -> Position speichern" um festzuhalten, wie das Programm beim nächsten mal sein Fenster öffnet.